毛丝鼠对于疾病的抵抗力较强。但若饲环境不良，饲料和饮水不够清洁卫生，饲养管理不良，毛丝鼠仍会发生各种疾病。因此在饲养管理中必须贯彻防重于治的方针，减少或杜绝疾病发生。
（一）消化道病
消化道病是毛丝鼠的常见病。根据我国毛丝鼠患病情况的统计，消化道病约占总发病率的50%左右，而且即使患其他疾病，有些也与消化道疾病有关。
1牙齿错合
由于鼠笼中长期缺乏供毛丝鼠咬啃的软木头、浮石，致使毛丝鼠牙齿（主要是门牙）生长过长，妨碍咀嚼而不能进食。
过长的门牙明显露在唇外，由正常的浅黄色变成白色，唇部红肿，口流唾液。轻者食量减少，常蹲在一处用前肢挠嘴巴，造成嘴周边和前肢内侧的毛被浸湿：重者停食停水，蹲在一隅，懒的动弹，机体瘦弱。
经常保证鼠笼中软木块的供应，防止牙齿徒长。用剪刀将门齿过长部分减掉，再用浸过消炎药水的棉球擦洗红肿唇部，连续处置3天左右。
2喉梗阻
食入大块的饲料或其他异物，以致吞咽困难而造成本病。毛丝鼠很难把食入口腔的食物吐出来。
小块食物梗阻后，毛丝鼠非常不安，跳动不停，常伸颈做吞咽动作，并伴有干咳声。主要病症是呼吸加快或呼吸困难。大块食物梗阻时，常很快就发生窒息，眼充血，四肢不能站立，直至死亡。
尸体解剖可见咽部组织水肿，喉与气管发炎，肺水肿，气管和支气管充满液体。
不要随意毛丝鼠吃较硬或带硬壳的大粒饲料，如松籽和大粒的豆类等。轻度梗阻要马上滴喂植物油润滑食道，使食物咽入胃内。严重梗阻往往来不及采取措施就窒息死亡。
3胃膨胀
由于食入大量易膨胀或发霉发酵的食物，在胃中遇水膨胀和产生大量气体所致。
食欲废绝，精神不振，眼睛呆滞，轻按胃部感到胃部内充满气体，病鼠有疼痛感。
禁喂易膨胀和发霉变质的饲料，不要单独喂给豆饼块和熟黄豆粉等。治疗时可用胃导管将胃内气体排除，但毛丝鼠食道较细，采取这种措施时必须小心谨慎。在此声明方法多种，有很多饲养商家都有自己的方法。
4胃卡他
胃卡他是胃粘膜表层的炎症，临床上以消化机能凌乱为主要病症
由于配合饲料中谷物饲料比例过大，缺乏粗纤维，食入不易消化的食物，突然改变饲料品种，供给的可口饲料数量过多，造成毛丝鼠暴食或者发生胃膨胀等，均易引起胃卡他。食入霉败变质或被农药污染的饲料，克引起中毒性胃卡他。误食泥沙，饮水不清洁，也能引起胃卡他。
急性者突然发病，精神不振，痛苦不堪，食欲减退或拒食。慢性者食欲减退，中等程度便秘，病鼠逐渐消瘦，体重减轻。多见流涎，下唇及两口角粘湿，被毛常被缠结。鉴别急、慢性胃卡他时，可将橡皮管插入胃中，并向胃内注入10%碳酸氢钠2-3毫升之后，立即用注射器吸出，如吸出液中含有带血丝的粘液，表明为急性胃卡他：如吸出液中含有浓稠带臭的粘液或粘液团块，则表明为慢性胃卡他。
急性胃卡他应停饲1-2天。用软饲料代替颗粒饲料，加喂鲜嫩青饲料，以葡萄糖牛奶为饮料。为减少对胃粘膜的刺激，可用氢氧化铝凝胶2-3毫升内服。慢性胃卡他主要是改善饲养管理，药物治疗多不奏效。
5便秘
引起便秘的原因主要是饲料，饲养不当和精神系统功能失调。各种食物中的营养物质主要在小肠中由胰液、胆汁和小肠液来消化，食物中的粗纤维依赖于大肠中微生物来消化。在整个消化过程中，还必须有一定量的水和电解质参与。因此如饲料的组成比例不当，质量低劣，过多饲喂不易消化的食物，突然改变饲料品种，精料或适口性好的饲料投喂过多和饮水不足等，都会不同程度的造成便秘，使肠道运动功能减弱，肠肌营养不良。饲养环境不安静，会造成神经性干扰。经常抓拿毛丝鼠，也会造成神经系统失调，并导致消化道运动不正常而发生便秘。
轻度便秘时并无明显症状，日排粪量略有减少，粪粒形状稍硬变小，粪粒中多无气孔，色泽变深。重者排粪明显减少或停止排粪，粪粒很小，干而硬。患鼠停食停水，蹲卧在一处懒的动弹，有拱背现象和疼痛状，精神不振，眼闭合。长时间便秘则逐渐消瘦，体重下降十分明显。
认真检查和调配好饲料，加强饲养管理，减少或避免人为干扰和抓鼠。应增加饮水量或补给一些油脂液剂和青绿、新鲜、易消化的饲料，如全脂奶粉、葡萄糖盐水、苹果、果汁、鲜苜蓿草嫩叶等。饲养疗法无效时，可采用以下药物治疗：1、用2%液体石蜡或软肥皂水口服或者直肠灌注，每次5-15毫升。2、用10%-15%的植物熟油水悬液口服或直肠灌注，每次5-10毫升。3、用双醋酚汀（每片5毫克）1-2.5毫克研碎，用阿拉伯胶（亦可用淀粉代替）制成添剂，涂布舌面后让其自行咽下。4、用开塞露直肠灌入，刺激直肠壁，引起肠管运动，促进粪便排出。
上述方法治疗便秘均有一定疗效。
6肠梗阻
多由便秘家重而造成。起因基本上与便秘相同，但是患食毛症的毛丝鼠发生此病比例较高。由于这些鼠食毛，在消化道中形成毛球而发生梗阻。另外食物中粗纤维含量甚少，用大剂量的抗生素治疗疾病，造成毛丝鼠肠道中微生物消化粗纤维的功能降低，也会引起便秘并继发为肠梗阻。因此，尽量少用或不用广谱抗生素，用磺胺类药物进行消炎治疗比较安全。
病初通常以便秘为先期症状，突然以急性症状发生者较少。病鼠精神沉郁，常蹲卧笼角，对事物刺激反应迟钝。被毛逆立、蓬乱，失去光泽，食欲减退或废绝，或仅采食少量鲜嫩青料。病初排粪甚少，粪粒明显干硬变小，粪便常附有粘液、粘膜或血液，数日内停止排粪。病鼠迅速脱水，眼球深陷。腹部常轻微鼓气，腹部触诊常可触及坚硬的粪块。病鼠表现腹痛，前肢伸向前方，腹着地而卧，四肢蜷缩。其中以十二指肠梗阻病势最为明显。
出现便秘后就要引起高度警惕，尽全力排出便秘，防止继发肠阻梗。当肠阻梗形成后，治疗以通便为主，如用油类泻剂不奏效，可试用10%-20%硫酸钠或硫酸镁溶液灌服。另用开塞露5毫升作为直肠注入，或用软肥皂水溶液深部灌肠，配合泻剂，对轻度肠梗阻有效。重症肠梗阻其肠壁发炎或者坏死者，使用泻剂不仅无效，反而有肠破裂的危险，必要时可试行手术治疗。
7腹泻
腹泻发病原因主要与食物有关。发病率以夏季为主，幼鼠比成鼠更易患此病。毛丝鼠食入含水分较多的饲料，颗粒饲料变潮，夏季饲喂青绿饲料过多，食入质量差的干草、油脂饲料、水果等，都能造成腹泻。
轻度腹泻队毛丝鼠影响不大，无异常表现。粪粒比较松软，较粘稠。外面包有一层粘状物，有的粪粒粘在笼网底。发生严重腹泻时，鼠粪比较稀软或呈糊状粘粪，污染肛门附近的被毛。病鼠经常舔肛门，表现不安，有时有疼痛感。腹泻尤其严重腹泻如不及时治疗，易继发为肠炎。
轻度腹泻可通过调整饲料治疗。比如，停止投喂一切含水分和油脂较多的饲料，同时把颗粒饲料和干草进一步烘干，加少量干蒜辫子、干葱叶。每天投喂1次配合粉（2份草粉，2份豆饼粉，1份高粱米面，适量的食盐），每次5克，可连喂2-4天。腹泻严重时，必须在调整饲料的同时采用药物治疗。为防止继发肠炎，要用磺胺和次没食子酸合剂0.5克，每日分两次投喂，连喂2-3天。
8肠炎
肠炎病具有传染性，发现此病应立即进行隔离治疗，同时全群进行消毒，防止病情扩散。
多由严重腹泻继发而成：或由于食入变质发霉的饲料和饮用污水等而造成。
也可能由于其他患病鼠的传染而引发。
鼠粪呈粘糊或稀水状，并伴有黄绿色粘液，或稀粪中带血丝。患病鼠肠道粘膜发炎，肠道温度和体温均升高，肛门温度高达37度以上（正常温度为36.5度左右）。病鼠食欲下降或废绝。体毛蓬乱，肛门附近的毛被污染。病鼠有疼痛感，萎缩在笼角懒得动弹。
对病鼠笼进行全面火焰消毒。其他鼠笼和食具用1%-2%高锰酸钾溶液喷雾和浸泡，或者用1%来苏儿液喷雾消毒。病鼠吃剩下的饲料全部清除干净，集中起来烧掉，饮水瓶和玻璃吸管全部更换。治疗采用氯霉素口服或注射，口服剂量为0.3-0.5克，注射剂量为0.35毫升，每天1次连续3-4天。也可采用口服磺胺与次没食子酸合剂0.5克和注射氯霉素0.35毫升相结合。在治疗食欲废绝的病鼠时，同时每日每只补充注射葡萄糖液2毫升。
9肠扭转和套叠
多由毛丝鼠在剧烈运动中突然发生，或者在配种过程中相互追逐、打架时发生。
此病一经发生，该鼠剧烈疼痛，四肢和全身发抖，不能站立，有时还发出“吱吱”的叫声。严重肠扭转和套叠可造成死亡。剖检可见扭转和套叠的肠管，粘膜极度充血，伴有出血现象。
对日活动量大的种鼠，尤其是活泼的幼鼠，主要注意观察，配种时要有人看守。这种病一般来的急，死亡快，往往来不及采取措施，病鼠就已死亡。抢救措施是人工捋顺肠管，方法是用左手拿鼠颈胸部，左手食指和中指夹住病鼠前肢，用右手的食指和中指由鼠的胸部向下捋顺多次。这种措施对有的病鼠可奏效。
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